本书中的新世界，世界观大体分为神秘侧与科学侧两大阵营。

　　然而两大阵营并非完全对立的存在——当这个世界中的人类面临着共同的威胁时，其团结与凝聚会让所有企图侵略奴役他们的敌人感到震撼。

　　新世界AD1999年所发生的一切就是最好的写照，面对接踵而至的无数灭世危机，神秘侧与科学侧携手合作，共同进退，使面临毁灭的人类焕发了新生。然而，在这来之不易的和平时期，属于人类内心的黑暗，似乎又开始了不安的涌动......

　　——神秘侧：

　　“魔法少女议会”：AD1932，由当时最为强大的十三位【魔法少女】构成的组织，目的为反抗孵化者以及其制造的魔女。

　　组织的每一位成员都为在当时某一领域的巅峰之人——某一国的领袖，军界、政界要人，科学家等等，可以说是集合了人类中的精英。所有成员都已经知晓了魔法少女与魔女的真实，因此决意从孵化者的手中拯救人类。

　　可惜的是，由于孵化者暗中的挑拨，组织内部出现了背叛者。议会陷入了第二次世界大战的泥潭之中，曾经的同伴划分阵营，互相猜忌甚至杀戮使议会分崩离析。等到人们醒悟之时，“议会”仅存的成员为席德拉（希特勒）、席德林（斯大林）、达姿、朱莉、妮娜五人。

　　然而AD1945，在广岛、长崎与【魔女之夜】的战斗中，由于孵化者的操控，身为议会领袖，最为强大的二人——席德拉、席德林在那里相继陨落，议会随之完全解体。

　　——神秘侧“三极”：

　　1.神圣光明同盟（罗马正教/俄罗斯成教）：神秘侧中最为庞大的组织，总部为意大利梵蒂冈。

　　最初为人类对抗【长生种】（参考词条），由教会为主体构成的同盟，有着无数的魔法师战斗员，甚至圣人坐镇。而在【长生种战争】期间，三教精锐所构成的战斗组织【AX】，其成员才为神秘侧真正的巅峰战力。人类成功击败长生种，并迫使其退守西伯利亚的异空间内。

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